Prácticas que implican la comparación múltiples de secuencias

1. [Tarea a realizar] Tras haber realizado en las prácticas anteriores una búsqueda de las secuencias de ácidos nucleicos y de proteínas de la acetolactato sintasa de plantas y haga una comparación con ellas usando el programaClustalOmega. Identifique los bloques de ácidos nucleicos y de proteínas que sean conservados.
• (NOTA: Aunque cuando se hace una aplicación seria y formal en un proyecto de investigación, es conveniente realizar la descarga del mayor número posible de secuencias (para darle valor estadístico y significación al estudio), en este caso vamos a hacer la comparación con solo 10 secuencias para acortar el tiempo)
2. Valore dichos consensos. En particular explique si hay algún patrón significativo en las comparaciones
3. Haga varios dendrogramas con el programa FigTree destacando aspectos que le hayar resultado relevante

1. Haga una comparación múltiple con las secuencias de proteínas P20472, P80079, P02626, P02619, P43305, P32930, Q91482, P02620, P02622, y P02627, y comente los resultados obtenidos.
   1. Compare los resultados usando Clustal, Tcoffe y MUSCLE
   2. Cambie las matrices de comparación de BLOSUM a PAM y discuta los resultados obtenidos (cuando el programa de comparación se lo permita)