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La interrelación existente entre la Aerobiología y otras ciencias condiciona el que uno de los objetivos principales sea que la información que se obtenga sobre el contenido de partículas biológicas en el aire tenga utilidad en un gran nmero de disciplinas y campos de aplicación: Biodiversidad, Agronomía, Ciencias Forestales, Fitopatología, Meteorología, Climatología, Ciencias Forenses, Bioterrorismo, Polinosis. Dado que la presencia de material biológico en la atmósfera se encuentra estrechamente relacionada con la ocurrencia de reacciones adversas que alteran la salud en los seres humanos, es fundamental la obtención de datos que puedan ayudar a la adopción de medidas de prevención. De ahí que algunos mecanismos de muestreo hayan sido diseñados para funcionar de manera similar al sistema de respiración y así obtener datos de gran aplicabilidad.
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